鎮江一戰，林毅的明軍大獲全勝。水戰和6戰共殲滅南軍4萬餘人，被俘虜的軍將包括施琅的叔叔施福在內近兩萬人。
所得的戰利品堆積如山，糧草馬匹，鑼鼓，帳篷，刀矛器械，大炮炸『藥』，殘破的戰船，等等應有盡有。
只清掃戰場就用了將近半個月的時間，岸上掩埋屍體尚好，江中打撈殘船和浮屍就是一項大工程，救治傷員的，修復戰船的，明軍忙得不亦樂乎。
這一戰明軍當然也有傷亡，岸上的傷亡微乎其微。可以忽略不計了，水師傷亡也不大，共有三艘艦船受了不同程度的損傷，有兩艘桅杆被炸壞，簡單修復一下，就可以投入使用。其中一艘被炸得解體了，這艘船就報廢了。但是船的殘骸打撈出來。
清點人馬連岸上帶水師，鎮江之戰明軍共傷亡了1ooo多人馬，包括三艘戰船。但卻繳獲了南軍連殘船在內1oo多艘，剩餘的都是沒有維修價值的報廢船隻。
林毅傳令在慶祝勝利，為將士們記功的同時，不能忘記這些傷亡的將士們，一一登記在冊，該搶救的搶救，該撫卹的撫卹，讓地方官做好死難和傷殘家眷的安撫工作，不能讓英雄們流血再流淚。
近2萬俘虜的改編問題也是件大事，需要一些時日。當然林毅對這些願意投降的俘虜也是優待的，政策跟與李自成和張獻忠等人交戰的時候是一樣的。不殺降，給他們一次機會，在這『亂』世各為其主，並非什麼罪大惡極者，戰敗了得允許他們投降，儘量給他們一條生路，讓他們改過自新。這一點根與韃子作戰不一樣。
林毅長期堅持的這種優待俘虜的策略獲得了廣泛的人脈和極好的口碑。現在與鄭芝龍的南軍交戰，這仍然是林毅優待俘虜的政策之一。
那些不願意投降的，仍然是教育登記之後就地遣散，並且明確告訴他們，這樣的機會不會有第2次。
願意繼續吃糧當兵的可以留下來接受改變，在明末『亂』世，當兵的大都是走投無路的，或者為了混口飯吃，不管誰當皇帝，其實與他們無關，只要給他們糧餉，他們就滿足了。
因此這2萬名俘虜大多數都願留下來，只有兩三千人選擇了被遣返還鄉。
但是這裡面有一個特殊的戰俘，那就是施琅的叔叔大將施福，拒不投降，只求一死。
對於這樣的俘虜當然不能輕易放了，林羽現在也不跟他磨嘴皮子，把它壓在了鎮江，命令閻應元，派專人看好他，也別提審他，該治傷治傷，吃喝拉撒，一日三餐供著，興許以後還會有用。
改編俘虜救治傷員的事就交給了南京的兵部尚書史可法，南京作為陪都，也有一套跟北京相似的朝廷機構，內閣六部，基本上都有，不能讓他們只在這裡養老，命他駐鎮江辦事，給他留下了3萬兵馬，負責處理戰後事宜。包括修復那些殘破的戰船，補充到明軍的水師中，這些事也交給了史可法等人。
林毅休整兵馬，修復了兩艘損壞的船隻之後，率領水6大軍十萬，繼續沿江而下。林毅的這1o萬人馬，包括他帶來的1萬名水師和標營等6個營的2萬兵馬，另外就是研究員在鎮江一帶的兵馬，抽出來6萬人，隨行勤王。
下一站的目標當然是江陰縣，這是閆應元的老家。
正在這時，兩廣戰場傳來捷報。林毅在廣西和貴州留下的，兩路人馬2o萬大軍，現在已經把南軍趕出了廣西和貴州，李定國和鄭大木的人馬全部敗退入廣東。現在的廣西和貴州，又全部併入了大明的版圖。
雲南王沐天波和宋獻策為的北路軍繼續東進，他們從貴州進入湖南的南部作戰，與當地的明軍配合，一舉把南軍向南趕出了湖南。
在西邊這兩路大軍2o萬兵馬的配合之下，不只是湖南的明軍取得了勝利，江西的和淮南的明軍也取得了很大的戰果，南軍被重新趕回了福建，浙江，江蘇。現在廣西，貴州，湖南，江西和淮南的明軍已經連成了一片，在這一帶作戰的明軍連同沐天波和周桂英這兩路兵馬在內，不下4o萬。
林毅聽了非常高興，形勢一片大好，鄭芝龍終於折騰到了最高峰，以後就像拋物線一樣，到了最高點必然要走下坡路了，明軍到處都在打勝仗，形勢一片大好。
他立即對京師的內閣和6部的官員下了諭旨，讓他們全力補給，對南軍的戰鬥，各個戰場所需要的槍炮子彈，糧餉軍需等，必須充足，源源不斷。另外，對光復的城池州縣，要及時派駐地方官，穩定民生。
這道諭旨剛傳下去，葡萄牙的使者又來了。他們真會打聽臨沂的所在，臨沂在廣西北部灣，他們追到廣西北部灣軍營，現在林毅到了長江岸邊的陰縣，葡萄牙大使這又攆過來了。。
這次來的仍然是那個愛德華，鑑於上一次在廣西北部灣的會晤，林毅對他就有些討厭，但不管怎麼樣還是在江中的揚威號鉅艦上接見了這位葡萄牙的使者。
一見面這位愛德華就有些強詞奪理，先對明軍進攻廣東表示強烈抗議，他甚至建議，立即坐下來與南帝鄭芝龍談判雙方疆土之事，並且大言不慚的表示，這是他們大葡萄牙帝國的核心利益所在。
林毅差點兒被齊氣樂了，這比滿清末年的八國聯軍還囂張霸道不講理吧。我們大明朝也好，大南帝國也好，你們葡萄牙遠隔重洋，屬於歐洲地域國家怎麼跑到亞洲東部，來耀武揚威？我們愛怎麼打怎麼打，這是我們內部之事，什麼時候輪到你們葡萄牙人來這指手畫腳？老子可不是晚清『政府』！
“這是我們大明內部之事，輪不到別人在這指手畫腳，澳門是大明的固有領土，租借期限早已到了，你們從哪來還回哪兒去，否則總有一天會讓你們見不到明天的太陽！”
林毅一番義正言辭的話，問的葡萄牙使者愛德華張嘴結舌，最後兩句話，直接把這位葡萄牙使者衝了個蛋朝上。
這位葡萄牙使者，氣的蛋皮都青了。最後滿臉脹紅，“監國大人，如果有人威脅到我們大葡萄牙帝國的利益，我們絕不答應，不惜兵戎相見，告辭！”
林毅道“我們大明帝國愛好和平，但從不懼怕戰爭，朋友來了有好酒，豺狼來了有獵槍，不送！”
這些葡萄牙人氣勢洶洶的走了。
小影和哲哲蘇茉爾等人再也受不了了，從營帳後面傳了出來。
“這些外國佬太嬌慣了，林大哥就應該把他的腦袋砍下來，看他們還囂不囂張？”
林毅淡然一笑道“兩國交兵，不斬來使，這不是戰場。如果他們膽敢把軍艦開過來，立即讓他們有來無回。”
蘇沫爾道“監國大人，要不要奴婢帶幾個人暗中教訓一下這些不知天高地厚的葡萄牙殖民者？”
林毅衝她搖了搖頭，“想收拾他們，早就把腦袋給砍下來了，根本不需要偷偷『摸』『摸』。他這是替鄭芝龍說話來了，如果他們膽敢真的出兵，戰場上就狠狠的教訓他們，讓他們成為孤魂野鬼，永遠回不了老家。”
這一天，林毅的冰封進了江陰縣。
遠在兩廣作戰的高桂英的南線戰場又傳來訊息，說李定國的人馬突然殺向澳門島去了。
林毅一聽立即作出指示命令他們停止攻打李定國，做好收拾葡萄牙殖民者的準備。
長江來到江陰縣，江面上已經變窄。
楊威號驅逐艦戰鬥編隊，大小1oo多艘戰艦佈滿了江面，浩浩『蕩』『蕩』，百舸爭流。
林毅在僚望倉，拿著望遠鏡，不時的注視著遠處的江面。1oo多艘各式大小戰船，環繞在揚威號4周，如正心捧月一般。
這時在最前面開路的一艘中號的戰船，突然船身一震，出了一聲沉悶的巨響，接著這艘艦船便擱淺了……
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